加入者個人の拠出した掛金額は全額所得控除（小規模企業共済等掛金控除）の対象となり、企業の拠出した掛金額は全額損金算入となります。

加入者が離職・転職した場合の個人の年金資産の移換や、確定給付型の企業年金から確定拠出年金への移行については、所定の手続きを前提として、所得税は非課税となります。

加入者が老齢給付金を一時金で受け取る場合、一時所得として所得税が課税されます。

加入者が障害給付金を一時金で受け取る場合、非課税となります。